Colossal Biosciences объявила о запуске ИИ-платформы GenoMorph, которая должна ускорить работу компании по восстановлению вымерших видов. Об этом эксклюзивно сообщил TechCrunch.
GenoMorph объединяет 3D-анализ морфологии, сравнительную геномику и биологию развития. Платформа помогает находить гены для редактирования в проектах по восстановлению вымерших животных, когда доступных генетических данных мало. Сейчас компания использует её в работе над возвращением птицы додо.
По словам компании, для проекта с додо у неё есть только один геном, тогда как в проекте по шерстистому мамонту удалось получить 100 геномов. Colossal объясняет это тем, что ДНК мамонта лучше сохраняется в холодном климате, чем ДНК додо в тропиках.
«Обычно учёные могут сравнивать много геномов, чтобы понять, какие генетические различия отвечают за определённые признаки, — сказал TechCrunch генеральный директор и сооснователь Colossal Бен Ламм. — С древней ДНК вымерших видов у нас такой возможности нет: материала очень мало, и мы можем получить лишь небольшое число полных геномов».
Для создания GenoMorph компания собрала данные о развитии кур, перепелов, уток и голубей, а также объединила их с генетической информацией и 3D-измерениями черепов более чем 70 видов птиц. По словам Ламма, на разработку платформы ушло больше года, при этом она опирается на несколько лет прежней работы компании по восстановлению вымерших видов.
Ламм пояснил, что ИИ отслеживает, какие участки ДНК активны по мере развития клюва и лицевых структур у разных птиц, а затем прогнозирует, какие генетические переключатели могли сформировать внешний вид додо. Он сравнил платформу с «картой сокровищ для генома додо», которая помогает искать значимые различия вместо перебора большого числа вариантов.
«На данный момент мы нашли примерно 2 300 перспективных целей для редактирования ДНК, связанных с черепно-лицевой морфологией додо, и теперь можем проверять их в лаборатории», — сказал он. По его словам, GenoMorph помогает решать одну из главных проблем таких проектов: определить, какие именно изменения делают вымерший вид уникальным. При этом учёным ещё предстоит проверить, приведут ли эти правки к нужным физическим признакам.
Компания также разработала систему, которая использует липидные наночастицы для доставки инструментов редактирования генов прямо в развивающиеся эмбрионы птиц. По словам Ламма, это позволит понять, как конкретные генетические изменения влияют на развитие птицы, не дожидаясь полного цикла размножения до половой зрелости.
Одновременно Colossal сообщила, что её колония никобарских голубей выросла до 36 птиц, а компания уже получила ключевые клетки, из которых формируются яйцеклетки и сперматозоиды.
«Поскольку никобарский голубь — ближайший ныне живущий родственник додо, эти клетки — важная часть нашей стратегии по созданию птиц с признаками додо», — сказал Ламм. Следующий шаг компании — подтвердить в лаборатории прогнозы GenoMorph.
«Самое важное сейчас в том, что технологии, которые мы разрабатывали по отдельности, начинают сходиться и помогать другим нашим проектам в совершенно другой части древа жизни», — добавил он.
Отвечая на вопрос о безопасности такого редактирования генов, Ламм заявил, что цель GenoMorph — сделать генную инженерию более точной, контролируемой и проверяемой. По его словам, платформа сама не редактирует гены, а лишь помогает команде понять, какие изменения стоит изучать.
«Нахождение потенциальной правки не означает, что мы сразу внесём её в животное или автоматически считаем её безопасной, — сказал он. — Чем точнее мы можем выявить и проверить эти изменения, тем более обоснованными становятся наши решения на каждом этапе процесса».
Новая технология Colossal уже получила поддержку со стороны Питера Диамандиса, основателя XPRIZE и инвестора компании. В среду он также объявил о запуске нового венчурного фонда NeoGenesis Capital, который будет инвестировать в компании, использующие платформу программируемой биологии Colossal в здравоохранении, сельском хозяйстве и природоохранных проектах.
Источник: TechCrunch.
